火疗的副作用比较小，一般出现的副作用都是由于消毒未彻底而导致的局部感染。但是火疗的禁忌症是有很多的，一般来说，大姨妈期间的妇女是不建议进行火疗的，有可能会导致血崩。高血压、低血糖、空腹、孕妇、癌症、心脏病、肾功能不全的患者都是不建议进行火疗，火疗以后要注意，禁止食用一切生冷食物。做完火疗平躺45分钟，12小时之内不能洗澡。
火疗的副作用主要是皮肤感染和增加内热。火疗可以排除体内寒气，而不是泄热。如果患者本身是热证或者阴虚体质，火疗后容易增加内热，容易出现大量出汗，使身体容易感到疲劳或者乏力，从而加重原有病情。另外，在皮肤损伤情况下做火疗，容易引起皮肤刺激导致皮肤感染。如果原有出血性疾病，火疗后容易导致出血加重等严重反应。
