火疗法的副作用相对较小,通常出现的副作用是由于未彻底消毒引起的局部感染。但火疗有许多禁忌症,一般而言,在大姨妈期间,女性不宜接受火疗治疗,因为这有可能造成血流不止。血压高,血糖低,肚子饿,孕妇,癌症,心脏病,肾功能不全的病人不能吃火疗,火疗之后要注意,不要吃任何生冷食物。火疗后平躺45分钟,12小时内不可淋浴。
火疗的副作用主要是针对身体有阴虚和热象的患者。进行火疗会致使体内的内热加重，容易出现上火的症状。包括心律失常，血压升高，牙龈肿痛，口腔溃疡，咽喉肿痛等疾病。在临床可在专业医生的指导下进行应用。
